Военный госпиталь сформирован 15.02.1946 г. на основании Директивы Оргмоботдела НР/010195 от 02.02.1946 г. по штату № 27/541 на 100 коек с дислокацией в городе Сызрань Куйбышевской области (Самарской области) по улице Володарского 79, на базе одного из эвакогоспиталей дислоцировавшегося в г. Сызрани в годы Великой Отечественной войны.
Со дня формирования подчинялся начальнику санитарного управления Приволжского военного округа, а с 1947 г. находился в подчинении Военно-медицинского управления ПриВО.
Во исполнении требований приказа Министра обороны РФ №613 от 12.10.2017 г., в соответствии с директивой ГШ ВС РФ №314/6/4640 с 1 января 2018 г. изменены тип и наименование филиала №4 федерального государственного казенного учреждения «426 военный госпиталь» Министерства обороны Российской Федерации на филиал №4 федерального государственного бюджетного учреждения «426 военный госпиталь» Министерства обороны Российской Федерации (филиал №4 ФГБУ «426 ВГ» Минобороны России).